Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnnd1P30999 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnnd1P30999 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms