Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtgfP29268 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtgfP29268 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms