Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TbpP29037 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TbpP29037 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TbpP29037 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TbpP29037 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TbpP29037 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TbpP29037 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TbpP29037 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TbpP29037 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TbpP29037 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TbpP29037 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TbpP29037 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TbpP29037 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TbpP29037 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TbpP29037 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TbpP29037 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TbpP29037 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TbpP29037 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TbpP29037 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TbpP29037 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TbpP29037 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TbpP29037 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TbpP29037 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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