Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PrkcdP28867 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms