Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprmP28828 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprmP28828 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprmP28828 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprmP28828 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprmP28828 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprmP28828 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprmP28828 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
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