Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kif5cP28738 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif5cP28738 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms