Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RxraP28700 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RxraP28700 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RxraP28700 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RxraP28700 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RxraP28700 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
RxraP28700 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RxraP28700 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RxraP28700 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RxraP28700 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms