Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apex1P28352 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apex1P28352 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apex1P28352 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apex1P28352 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Apex1P28352 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apex1P28352 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apex1P28352 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms