Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aco1P28271 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aco1P28271 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms