Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb3P28231 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb3P28231 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms