Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms