Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms