Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChgaP26339 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ChgaP26339 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms