Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnna1P26231 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnna1P26231 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnna1P26231 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnna1P26231 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnna1P26231 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnna1P26231 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnna1P26231 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnna1P26231 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctnna1P26231 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnna1P26231 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms