Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk11bP24788 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms