Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gria1P23818 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms