Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd12P23812 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd12P23812 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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