Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tsta3P23591 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tsta3P23591 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tsta3P23591 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tsta3P23591 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tsta3P23591 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tsta3P23591 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tsta3P23591 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms