Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms