Protein–RNA interactions for Protein: P20863

Gdf1, Embryonic growth/differentiation factor 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf1P20863 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdf1P20863 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdf1P20863 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms