Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Fcer1aP20489 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fcer1aP20489 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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