Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NelfeP19426 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NelfeP19426 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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