Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rps6ka1P18653 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rps6ka1P18653 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms