Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18532 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P18532 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18532 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18532 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18532 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18532 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18532 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18532 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18532 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P18532 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P18532 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18532 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P18532 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18532 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms