Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18524 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18524 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18524 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18524 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
P18524 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18524 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18524 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18524 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18524 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P18524 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18524 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18524 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18524 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18524 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18524 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18524 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18524 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18524 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18524 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18524 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18524 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18524 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18524 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18524 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18524 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P18524 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18524 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18524 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18524 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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