Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd48P18181 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd48P18181 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms