Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp53P15975 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp53P15975 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp53P15975 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Usp53P15975 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp53P15975 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms