Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmnb1P14733 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lmnb1P14733 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb1P14733 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms