Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd5P13379 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd5P13379 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd5P13379 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd5P13379 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms