Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb1P12658 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb1P12658 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Calb1P12658 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb1P12658 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Calb1P12658 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Calb1P12658 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms