Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp1P12032 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp1P12032 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms