Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd4P10628 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms