Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatspereP0DP43 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CatspereP0DP43 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms