Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxb2P0C1T1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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