Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NefmP08553 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NefmP08553 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NefmP08553 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NefmP08553 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NefmP08553 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NefmP08553 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NefmP08553 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NefmP08553 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NefmP08553 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NefmP08553 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NefmP08553 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NefmP08553 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NefmP08553 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefmP08553 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefmP08553 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefmP08553 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefmP08553 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefmP08553 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefmP08553 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefmP08553 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefmP08553 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefmP08553 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefmP08553 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefmP08553 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefmP08553 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NefmP08553 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefmP08553 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefmP08553 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefmP08553 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefmP08553 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefmP08553 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefmP08553 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefmP08553 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefmP08553 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefmP08553 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefmP08553 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefmP08553 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NefmP08553 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefmP08553 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefmP08553 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefmP08553 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefmP08553 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefmP08553 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefmP08553 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NefmP08553 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefmP08553 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefmP08553 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefmP08553 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefmP08553 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NefmP08553 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NefmP08553 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NefmP08553 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NefmP08553 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NefmP08553 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NefmP08553 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NefmP08553 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NefmP08553 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NefmP08553 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NefmP08553 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NefmP08553 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NefmP08553 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NefmP08553 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms