Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamc1P02468 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lamc1P02468 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lamc1P02468 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms