Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-Ab1P01921 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-Ab1P01921 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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H2-Ab1P01921 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Ab1P01921 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H2-Ab1P01921 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H2-Ab1P01921 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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H2-Ab1P01921 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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H2-Ab1P01921 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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H2-Ab1P01921 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Ab1P01921 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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H2-Ab1P01921 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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