Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01822 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01822 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01822 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01822 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01822 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01822 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01822 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01822 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01822 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01822 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01822 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01822 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01822 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01822 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01822 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01822 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01822 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01822 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01822 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01822 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01822 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01822 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01822 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01822 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01822 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms