Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01808 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01808 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01808 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01808 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01808 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01808 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01808 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01808 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01808 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01808 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01808 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01808 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01808 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01808 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01808 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01808 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01808 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01808 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01808 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01808 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01808 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01808 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01808 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01808 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01808 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms