Protein–RNA interactions for Protein: P01795

Ig heavy chain V region M167, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01795 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01795 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01795 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01795 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01795 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01795 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01795 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01795 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01795 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01795 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms