Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01746 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01746 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01746 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01746 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01746 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01746 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01746 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01746 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01746 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01746 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01746 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01746 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01746 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01746 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01746 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01746 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01746 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01746 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01746 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01746 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01746 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01746 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms