Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01653 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01653 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01653 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01653 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01653 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01653 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01653 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01653 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01653 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01653 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01653 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01653 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01653 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01653 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01653 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01653 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01653 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01653 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01653 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01653 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01653 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01653 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01653 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01653 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01653 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01653 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01653 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01653 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01653 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01653 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01653 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01653 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01653 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01653 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01653 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01653 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01653 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms