Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sypl2O89104 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl2O89104 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms