Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Robo1O89026 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Robo1O89026 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Robo1O89026 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Robo1O89026 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Robo1O89026 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Robo1O89026 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Robo1O89026 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Robo1O89026 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Robo1O89026 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Robo1O89026 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Robo1O89026 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Robo1O89026 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms