Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcn2O88703 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcn2O88703 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms