Protein–RNA interactions for Protein: O88627

Slc28a2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a2O88627 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc28a2O88627 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms