Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cacng2O88602 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms