Protein–RNA interactions for Protein: O88342

Wdr1, WD repeat-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr1O88342 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Wdr1O88342 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms