Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hcn4O70507 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hcn4O70507 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms