Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx7O70439 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx7O70439 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx7O70439 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx7O70439 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx7O70439 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms